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Seminar: Regulatorische und metabolische Netze

Dozent Prof. Dr. A. Zell, Adrian Schröder, Andreas Dräger, Jochen Supper
Sprechstunde n.V. (vorher anrufen oder E-Mail)
Zeit Wird in der Vorbesprechung festgelegt
Umfang 2
Beginn SS 08
Vorbesprechung Montag, 14. April 2008, 14h ct.
Ort A302, Änderungen vorbehalten
Turnus unregelmäßig

Beschreibung:
In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsthemen der Modellierung und Rekonstruktion regulatorischer Netzwerke behandelt. Das Seminar gliedert sich in fünf aufeinander aufbauende Themengebiete. Diese beschreiben ein methodisches Vorgehen, um ausgehend von biologischen Daten ein systembiologisches Modell zu konstruieren.

  1. Einführung in die Systembiologie
  2. Clustering und Genmodule
  3. Rekonstruktion der Struktur regulatorischer Netzwerke
  4. Dynamische Simulation
  5. Ausblick

Teilnehmende halten ein Referat auf Deutsch oder Englisch (45min + 15min Diskussion) und erstellen eine schriftliche Ausarbeitung (ca. 15-20 Seiten entsprechend der unten angegebenen Stilvorlage).

Themen und Termine
Datum Thema Betreuung Referent(in)
04.06.2008 Systembiologie - ein Überblick Andreas Dräger  
04.06.2008 Regulatorische Prozesse in Eukaryonten Adrian Schröder  
11.06.2008 Hochdurchsatzmessverfahren Adrian Schröder  
11.06.2008 Einführung in Clustering-Methoden Jochen Supper Axel Schüssler
18.06.2008 Rekonstruktion von Genmodulen Jochen Supper  
18.06.2008 Korrelationsanalysen regulatorischer Netzwerke Adrian Schröder  
25.06.2008 Regressionsanalysen regulatorischer Netzwerke Jochen Supper  
25.06.2008 Integration regulatorischer und physikalischer Interaktionen Adrian Schröder  
02.07.2008 Grundlagen biochemischer Modellierung Andreas Dräger  
02.07.2008 Standards in der Systembiologie: SBML, SBO und verfügbare Software Andreas Dräger  
09.07.2008 Modellierung komplexer Systeme Andreas Dräger  
09.07.2008 Synthetische Biologie und Perspektiven Jochen Supper  
  Warteliste    

Voraussetzungen:
Abgeschlossenes Grundstudium bzw. Bachelor

Literatur:
Literatur bzw. Publikationen werden im Seminar ausgegeben.
Falls vorab schon Interesse an Material besteht, melden Sie sich bitte via E-Mail bei {andreas.draeger, adrian.schroeder, jochen.supper} at uni-tuebingen.de.

Bemerkungen: 
Besonders geeignet für Studierende der Bioinformatik. 

Stilvorlage

  • Für die Erstellung der Ausarbeitung mit Word97/2000 gibt es hier eine Stilvorlage (Word97-Format, 27kB).
  • Wenn Sie eine andere Textverarbeitung bevorzugen, orientieren Sie sich bitte an diesem Muster (PDF-Format, 13kB).
  • Für Latex-Fans gibt es einen Style mit kleiner Demo.



Last changes: 05.09.2008, 10:28 CEST. RA-Webmaster. Impressum
http://www.ra.cs.uni-tuebingen.de/lehre/ss08/sem_systembio.html
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