Dräger, Andreas

Suche häufiger Proteinfragmente unter Berücksichtigung von Mutationen und Lücken

Projektarbeit, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, von-Seckendorff-Platz 1, 06120 Halle (Saale), 2003


Abstract

Bei Analysen biologischer Daten stellt die Suche nach häufigen Teilsequenzen in Proteinsequenzen eine wichtige Fragestellung dar. In dieser Arbeit wird ein Algorithmus beschrieben, der aus gegebenen Proteinsequenzen alle häufigen Muster fester Länge herausfindet. Es werden dabei nicht nur echte Teilsequenzen betrachtet, sondern auch allgemeinere Muster, bei denen einzelne Zeichen variieren dürfen. Dieses Vorgehen wird im Folgenden vorgestellt, und unter verschiedenen Aspekten durchgeführte Laufzeitmessungen werden präsentiert.


BibTeX

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