Öffentliche, biologische Online-Datenbanken ermöglichen schnelle Antworten auf Einzelabfragen. Komplexe Abfragen erfordern hingegen lange Wartezeiten. Eine lokale Installationen der Datenbanken würde diesem Problem entgegen wirken. Bestandteil dieser Arbeit ist die Schaffung eines Prototypen der integrativen Interaktions-Wissensbasis WINTER KB (Wildau INTERaction Knowledge Base). Hierfür wird öffentliches und proprietäres Wissen in einer lokalen, relationalen Datenbank zusammengefasst. PubMed, UniProt/SwissProt, IntAct, MINT,Entrez Gene, NCBI Taxonomy, Gene Ontology sowie die proprietäre Datenbank IPA finden ihre Verwendung. Mit Hilfe der darin enthaltenden Daten können DGL-Systeme f"ur Konzentrationsverläufe "uber die neu entwickelte Weboberfläche erstellt werden. Des Weiteren kann die Mutual Information zwischen den Zufallsvariablen Protein, Hub und Funktion errechnet werden. Erwartungsgemäß ist die Mutual Information der integrierten proprietären Ingenuity®-Daten deutlich höher als die der integrierten öffentlichen Daten aus IntAct, MINT und UniProt/SwissProt.
@mastersthesis{Tscherneck2009a,
author = {Tscherneck, Stephanie},
title = {{Aufbau einer integrierten Wissensbasis zur quantitativen Modellierung
von Proteininteraktionen}},
school = {Universtity of Applied Sciences Wildau (UASW)},
year = {2009},
type = {Masterthesis},
address = {Bahnhofstr. 1, 15745 Wildau (Germany)},
month = aug,
abstract = {{\"Offentliche, biologische Online-Datenbanken erm\"oglichen schnelle
Antworten auf Einzelabfragen. Komplexe Abfragen erfordern hingegen
lange Wartezeiten. Eine lokale Installationen der Datenbanken w\"urde
diesem Problem entgegen wirken. Bestandteil dieser Arbeit ist die
Schaffung eines Prototypen der integrativen Interaktions-Wissensbasis
WINTER KB (Wildau INTERaction Knowledge Base). Hierf\"ur wird \"offentliches
und propriet\"ares Wissen in einer lokalen, relationalen Datenbank
zusammengefasst. PubMed, UniProt/SwissProt, IntAct, MINT,Entrez Gene,
NCBI Taxonomy, Gene Ontology sowie die propriet\"are Datenbank IPA
finden ihre Verwendung. Mit Hilfe der darin enthaltenden Daten k\"onnen
DGL-Systeme f"ur Konzentrationsverl\"aufe "uber die neu entwickelte
Weboberfl\"ache erstellt werden. Des Weiteren kann die \emph{Mutual
Information} zwischen den Zufallsvariablen Protein, Hub und Funktion
errechnet werden. Erwartungsgem\"a{\ss} ist die Mutual Information
der integrierten propriet\"aren Ingenuity\textregistered-Daten deutlich
h\"oher als die der integrierten \"offentlichen Daten aus IntAct,
MINT und UniProt/SwissProt.}},
}